Сергей Анисимов имеет многолетний опыт работы за рубежом (США и Швеция)  и в России, участвовал в качестве исполнителя и руководителя в многочисленных научных проектах в области клеточной и молекулярной биологии, и биоинформатики, — в том числе связанных с дизайном, опытно-конструкторским производством и практическим применением биологических чипов разных типов, в том числе получивших большую известность платформ NIA15K (США) и NeuroStem (Швеция, Израиль). Автор свыше 80 печатных работ по клеточной и молекулярной биологии, чиповой технологии, биоинформатике. Свыше 3000 зарегистрированных в базе данных Google Scholar цитирований, Индекс Хирша = 24, i10 индекс = 37; входит в Тор-20 самых цитируемых российских ученых по специальности «Биотехнологии»; член редакционных советов нескольких научных журналов.